El tampón de reacción para la ADN polimerasa Phire Hot Start II Thermo Scientific está disponible en tres formatos: versión sin color con y sin detergentes (F-524L y F-525L, respectivamente) o versión verde (F-527L) que contiene un reactivo de densidad y dos tintes de seguimiento para la carga directa de productos de PCR en gel. El tampón de color no interfiere con el rendimiento enzimático y es compatible con aplicaciones posteriores como la secuenciación del ADN, la unión y la digestión de restricción.
La concentración de Mg2+ en los tampones de reacción está optimizada para funcionar bien en la mayoría de los amplicones. El tampón contiene 1,5 mm de MgCl2 en la concentración de la reacción final. Se proporcionan tubos independientes de MgCl2 y DMSO para una mayor optimización.