Das Ion AmpliSeq™ Comprehensive Cancer Panel bietet eine hochgradig multiplexe Zielauswahl der Gene, die in der Krebsforschung als wichtige Faktoren impliziert wurden. Mit mehr als 50 % der vom Wellcome Trust Sanger Institute erfassten Krebsgene ist dies das umfassendste verfügbare Krebsgen-Panel. Mit einer Abdeckung aller Exone von 409 Genen bietet das Ion AmpliSeq™ Comprehensive Cancer Panel eine schnelle, FFPE-kompatible Zielauswahl für eine umfangreiche Erfassung der wichtigsten Gene für die Halbleitersequenzierung. Zeigen Sie die Ion AmpliSeq™ Comprehensive Cancer Panel Liste von Zielgenen an (PDF).

Die Ion AmpliSeq™ Technologie ermöglicht extrem hohe Multiplex-PCR in Kombination mit einer gezielten Sequenzierungsbibliotheks-Erstellung in nur 16 Stunden für über 400 Gene. Mit nur 10 ng Ausgangs-DNA pro Primerpool und insgesamt 40 ng Ausgangs-DNA ist eine Analyse von eingeschränkten Proben wie FFPE-Proben möglich. Das Ion AmpliSeq™ Comprehensive Cancer Panel ist für die Bibliothekserstellung mit dem Ion AmpliSeq™ Library Kit 2.0 optimiert. Bibliotheken sind dann für die Template-Vorbereitung auf dem Ion OneTouch™ System und die Sequenzierung auf dem Ion PGM™ Sequenzer bereit. Das Ion AmpliSeq™ Comprehensive Cancer Panel ist nicht kompatibel mit Ion Ampliseq™ 2.0 Beta-Kits.

Merkmale und Vorteile:

• Umfangreiche Erfassung von 409 wichtigen Genen in einer einfachen PCR-Reaktion, keine zusätzliche Kapitalausstattung erforderlich
• Beispiellose multiplexe Kapazität von 16.000 Primer-Paaren in nur vier Pools mit Ion AmpliSeq™ Technologie
• Geringe DNA-Ausgangsmenge von nur 40 ng DNA und kurze Amplikonen ermöglichen FFPE-Proben und Nadelbiopsien
• Schnelles Starten von umfassenden genomischen Studien mit vordefinierten Primer-Pools
• Vereinfachte Analyse und Annotation von Varianten mit Ion Reporter-Software™

Umfassender Gengehalt einschließlich Genen vom Hotspot Panel
Ion Torrent entwickelte das umfangreichste Krebspanel für die Sequenzierung mit Ion PGM™ und bald auch mit Ion Proton™ Sequenziergeräten. In Zusammenarbeit mit bedeutenden Krebsforschern und durch Studie von Literatur und Datenbanken wurde das Ion AmpliSeq™ Comprehensive Cancer Panel so konzipiert, dass alle Exone der wichtigsten Tumorsuppressorgene und Onkogene, die am häufigsten zitiert werden und mutieren, erfasst werden. Strategisch konzipiert, um CDS und Splice-Varianten über mehrere Gen-Familien gleichzeitig abzufragen, erstellt die Pfad-basierte Genauswahl Profile von Mutationsspektren bei Krebsgenen und Wirkstoffzielen, zusammen mit Signalkaskaden, Apoptose, DNA-Reparatur, Transkriptionsregulatoren, entzündliche Reaktion und Wachstumsfaktorgenen in einem einzigen Assay. Darüber hinaus sind alle Gene des fokussierten Ion AmpliSeq™ Cancer Panels im Ion AmpliSeq™ Comprehensive Cancer Panel enthalten, wodurch entsprechende ergänzende Daten bereitgestellt werden.

Unerreichtes Niveau für Multiplex-PCR
Das Ion AmpliSeq™ Comprehensive Cancer Panel besteht aus vier Primer-Pools mit insgesamt fast 16.000 Primer-Paaren, die 409 Gene abdecken – dies entspricht ca. 4.000 Primer-Paaren in jedem Pool! Das in Verbindung mit dem Ion AmpliSeq™ Library Kit 2.0 verwendete Ion AmpliSeq™ Comprehensive Cancer Panel sorgt für hohe Einheitlichkeit und Spezifität bei dieser hohen multiplexen Kapazität, was in der Multiplex-PCR neue Maßstäbe setzt.

Über 400 Gene, nur 40 ng DNA erforderlich
Während andere Zielauswahlverfahren typischerweise DNA-Ausgangsmengen im Mikrogrammbereich erfordern, verwendet das Ion AmpliSeq™ Comprehensive Cancer Panel nur 40 ng DNA. Dieser Fortschritt bezüglich der niedrigen DNA Ausgangsmengen ermöglicht die Untersuchung von eingeschränkten Proben wie Formalin-fixierten, Paraffin-eingebetteten Proben (FFPE) und Feinnadelaspirationsbiopsaten (FNAB). Darüber hinaus bietet das kürzere Amplikon-Design (durchschnittlich 155 bp) Kompatibilität mit degradierten Proben.

Vereinfachte Zielauswahl ohne Primer-Design
Mit vordefinierten Primern im Ion AmpliSeq™ Comprehensive Cancer Panel können Forscher die Genauswahl, das Primer-Design und die Optimierung umgehen und gleich mit der Ergebniserzeugung beginnen, um einen breiten Einblick in Hunderte von Genen in wichtigen Forschungsproben zu erhalten. Um Ihre Krebsforschung weiter zu fokussieren, können Sie umfassende Analysen somatischer Varianten an einer Teilmenge von Genen oder einem spezifischen Krebs-Subtyp durchführen. Mit Ion AmpliSeq™ Designer können Forscher einfach Gene aus diesem Panel hinzufügen oder entfernen, um ihre eigenen maßgeschneiderten Panels zu erstellen. Die Flexibilität und Skalierbarkeit von Ion AmpliSeq™ Lösungen umfasst gebrauchsfertige Ion AmpliSeq™ Panels sowie maßgefertigte Ion AmpliSeq™ Panels.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für therapeutische oder diagnostische Zwecke an Tieren und Menschen.