La adenosina 5'-trifosfato (A-12410) BODIPY FL y la guanosina 5'-trifosfato BODIPY FL se componen de un fluoróforo BODIPY FL fijado a la posición 2' o 3' del anillo de ribosa a través de un enlace. Las interacciones entre el fluoróforo y la base de purina son evidentes a partir de las propiedades espectroscópicas de estos análogos de nucleótidos. El rendimiento cuántico de fluorescencia de GTP BODIPY FL es solo aproximadamente una décima parte del de ATP BODIPY FL; sin embargo, este rendimiento puede mejorarse tras la unión de GTP BODIPY FL a proteínas de unión a GTP.