차세대 발현 프로파일링 연구를 지원하기 위해 설계된 GeneChip™ Human Transcriptome Array 2.0은 유전자에서 생산되는 알려진 모든 전사체 동형을 정확하게 검출하기 위해 필요한 포괄적 범위와 정확도를 제공하여 유전자 수준 발현 프로파일링을 넘어선 능력을 제공합니다.

HTA 2.0의 내용물 및 범위에 대한 자세한 내용은 데이터 시트를 참조하십시오.

전사체의 포괄적 연구
수만 개의 인간 유전자에는 수십만 개의 서로 다른 전사체 동형을 생산하는 수십만 개의 엑손이 포함되어 있음이 연구를 통해 밝혀졌습니다. 이러한 전사체 동형은 유전자의 엑손이 이 유전자에서 생산된 최종 처리된 메신저 RNA 내에 포함되거나 또는 제외되었을 때 생산됩니다. 지금까지 이러한 전사체 동형의 측정 및 분석은 기술적 한계, 시료 입력 요건, 분석 능력/도구의 부족 등으로 거의 불가능했습니다.

포괄적 전사체 분석에는 여러 데이터 소스로부터의 전사체 다양성을 결합하는 것이 필요합니다.
대부분의 유전자는 복수의 전사체 동형을 생산하는데 각 동형의 상대적 양의 변화를 측정하면 질병과 생물학에 대한 새로운 통찰력을 제공해 줍니다. HTA 2.0은 여러 데이터 소스를 결합하여 사용 가능한 가장 광범위한 전사체 동형의 집합에 대한 독립적 분석이 가능합니다.

분석 설계 및 주석화에 사용되는 데이터 소스
RefSeq                                    Vertebrate Genome Annotation(Vega) 데이터베이스
Ensembl                                   MGC Mammalian Gene Collection(v10)
UCSC Known Genes               www.noncode.org
UCSC lincRNA 전사체        lncRNA db
Broad Institute, Human Body Map lincRNAs 및 TUCP(transcripts of uncertain coding potential(불확실한 코딩 잠재력을 가진 전사체)) 카탈로그

2개의 전체 레인 염기서열분석보다 개선된 데이터
자세한 정보는 아래 관련 문서 섹션의 HTA 2.0 제품 전단지를 참조하십시오. HTA 2.0은 전사체에 대한 가장 포괄적인 관점이 결합된 탁월한 정확도와 정밀도를 제공합니다.

어레이 설계에 생물정보학 적용, 어셈블리 불필요
HTA 2.0은 어레이에서 합성되는 보존 염기서열의 최소화를 통해 가능해진 고유하고 가치있는 정보의 양을 극대화합니다. 이 고분해능 어레이 설계에는 코딩 전사체와 비코딩 전사체를 포괄하는 전례없는 >6.0백만개의 프로브가 포함되어 있습니다. 이 어레이 프로브의 70%는 코딩 전사체의 엑손에 해당하며 어레이의 나머지 30%의 프로브는 엑손간 스플라이스 접합부와 비코딩 전사체에 해당합니다. 이 어레이의 불균등한 포괄 범위는 사용 가능한 모든 코딩 및 비코딩 전사체에 대한 깊은 통찰력을 제공합니다.

간편하고 신속한 무료 분석 솔루션
최초로 HTA 2.0은 Expression Console™ Software 및 TAC Software와 결합하여 연구자에게 수 분 안에 데이터에서부터 의사 결정에 이르는 단계에 필요한 일체의 솔루션을 제공합니다. 이러한 완전한 분석 솔루션은 당사의 발현 어레이를 사용하는 모든 연구자에게 무료로 제공됩니다. 이 외에도 HTA 2.0 데이터 분석은 다른 발현 어레이 데이터에 사용되는 동일한 분석 솔루션과 서비스 제공자에 의해 지원됩니다.

관련 링크
GeneChip™ 혼성화, 세척 및 염색 키트