Ion AmpliSeq™ Direct FFPE DNA Kit는 탈파라핀화 또는 DNA 정제 없이도 Ion AmpliSeq 프로토콜을 사용해 라이브러리를 구축할 수 있도록 FFPE(formalin-fixed, paraffin-embedded) 조직에서 DNA를 준비해 줍니다. 이 키트는 최대 10 μm 두께의 FFPE 조직 절편에 적합합니다.

Ion AmpliSeq Direct FFPE DNA Kit의 특징:
• 샘플 손실을 최소화하는 간단한 단일 튜브 2단계 프로토콜
• 단 10분의 hands-on 시간이 소요되는 효율적인 30분 workflow
• 미량의 DNA를 함유한 FFPE DNA 샘플에 적합
• FFPE 절편의 탈파라핀화가 필요 없음
• 컬럼 또는 비드 기반 DNA 정제가 필요 없음
• 1ng의 DNA 샘플만으로도 Ion AmpliSeq 라이브러리 준비
• 탈아미노화된 cytosine을 제거하는 선택적 단계인 Uracil-D-glycosylase 처리

미량의 DNA를 함유한 샘플에서 DNA 추출
보관된 조직 샘플을 통해 임상적으로 관련된 정보를 확보할 수 있지만, 이 샘플이 함유한 소량의 핵산을 분리하기 어려울 수 있습니다. FFPE 조직 절편의 탈파라핀화와 DNA 정제는 복잡한 다단계 절차로서 상당한 hands-on 시간이 필요하고, 그 과정에서 발생하는 샘플 손실로 인해 미량의 DNA를 함유한 FFPE DNA 샘플을 처리하는 과정이 불안정해집니다.

보다 간편하고 빠른 방법
Ion AmpliSeq Direct FFPE DNA Kit는 FFPE 조직 절편의 탈파라핀화와 DNA 정제가 필요하지 않은 사용자에게 친숙한 프로토콜을 사용합니다. 유리 슬라이드에 놓인 FFPE에서 Transfer Solution을 사용해 타깃 영역을 제거하고 PCR 튜브 또는 96-well 플레이트에 피펫팅합니다. Direct Reagent을 추가한 후 샘플을 65°C에서 15분 간 배양합니다. 이제 FFPE DNA를 Ion AmpliSeq™ 라이브러리 준비 프로토콜에 사용할 수 있습니다. 필요에 따라 Qubit™ HS DNA Quantitation Kit를 사용해 준비된 FFPE DNA를 정량화할 수 있습니다. 이 간편한 프로토콜은 복잡한 탈파라핀화와 DNA 추출 절차가 필요 없고, 라이브러리는 직접 또는 자동 Ion Chef™ System을 사용해 준비할 수 있습니다.