El análogo nucleótido TNP-ATP está modificado en la fracción de ribosa y es esencialmente no fluorescente en el agua. Los nucleótidos de la TNP experimentan una transición de equilibrio a una estructura semiquinoide que tiene propiedades espectrales de longitud de onda relativamente larga; esta forma solo es fluorescente cuando se une al sitio de unión de nucleótidos de algunas proteínas.