Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2

Das Ion AmpliSeq™Cancer Hotspot Panel v2 ist ein Einzelpool mit Primern zur Durchführung von Multiplex-PCR zur Vorbereitung von Amplicon-Bibliotheken aus genomischen „Hot Spot“-Regionen, die in menschlichen Krebsgenen häufig mutiert sind (Herunterladen der Liste von Zielgenen und Mutationen für das Ion AmpliSeq™Cancer Hotspot Panel v2). Das neueste gebrauchsfertige Ion AmpliSeq™Panel baut auf den in unserem ursprünglichen Ion AmpliSeq™Cancer Panel enthaltenen Mutationen auf und bietet:
• Die Kompatibilität mit FFPE-Proben wurde beibehalten, während der Mutationsinhalt für eine breitere Abdeckung zusätzlicher Gene und Hotspot-Mutationen erweitert wurde.
• Extrem einheitliche Abdeckung für effizientere Sequenzierung und Kosteneinsparungen
• Verbessertes Primer-Design mit Optimierung neuer Primer-Sets und noch geringerer Strangvorspannung für mehr Vertrauen in präzise Variantenabrufe
• Verbesserte Variantendetektion mit Torrent Suite Software v3.0 und Variant Caller Plugin bei der Detektion von Varianten mit geringen Allelen zusammen mit verbesserter Indel-Empfindlichkeit

Zusätzlicher Mutationsinhalt für Advancing Cancer Research Studies
Das Ion AmpliSeq™Cancer Hotspot Panel v2 wurde entwickelt, um 207 Amplicons zu verstärken, die etwa 2.800 COSMIC-Mutationen von 50 Onkogenen und Tumorsuppressorgenen abdecken. Dazu gehören die 739 COSMIC-Mutationen von 46 Genen im ersten Ion AmpliSeq™ Cancer Panel in Verbindung mit zusätzlichen Hotspot-Mutationen signifikanter Krebsgene. Unter Beibehaltung der Kompatibilität mit FFPE-Proben und Einbeziehung der gleichen Ziele wie der des ersten Ion AmpliSeq™ Cancer Panel haben wir durch Hinzufügen mehrerer Amplicone für Hotspots in EZH2, GNA11, GNAQ und IDH2, sowie durch Zugabe von etwas längeren Ampliconen, zusätzliche Mutationen hinzugefügt, um Ihre Krebsforschung voranzubringen. Das Ion AmpliSeq™Cancer Hotspot Panel v2 sollte mit dem Ion AmpliSeq™Library Kit 2.0verwendet werden.

Effizientere und kostengünstigere Sequenzierung mit extrem gleichmäßiger Abdeckung
Das verbesserte Primer-Design im Ion AmpliSeq™Cancer Hotspot Panel v2 verbessert die Homogenität der Abdeckung der Ion AmpliSeq™-Technologie. Mit einer gleichmäßigeren Einbeziehung wird bei viel weniger Sequenzierungsdurchsatz eine minimale Tiefe über alle Amplicone hinweg erzielt. Daher können zusätzliche Proben mit beliebigen Ion-Chips multiplexiert werden. Dies führt durch effizientere Sequenzierung bei gleichzeitiger Beibehaltung einer hohen Zuverlässigkeit beim Variant Call zu Kosteneinsparungen. Darüber hinaus bietet die geringe Strangvorspannung in den Primer-Sets des Ion AmpliSeq™Cancer Hotspot Panel v2 ein weiteres Vertrauen in präzise Variantenaufrufe.

Einfachheit, Geschwindigkeit und Skalierbarkeit der Ion AmpliSeq™Technologie
Das™Ion AmpliSeq™Cancer Hotspot Panel v2 ermöglicht krebsgenetische Untersuchungen aus FFPE-Gewebe mit nur 10 ng Input-DNA für eine gezielte Bibliothekserstellung. Das Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2 hält darüber hinaus auch den revolutionären Arbeitsablauf mit Standard-PCR-Ausrüstung und einer einfachen PCR-Reaktion für die ultrahohe Multiplex-PCR-basierte Zielauswahl aufrecht, und es besteht keine Notwendigkeit für umfangreiche Investitionen. Darüber hinaus erzielen Sie mit dem Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2 auch weiterhin die schnellste Erzeugung von Zielbibliotheken in ca. 3,5 Stunden. Skalierbarkeit und Flexibilität bleiben auch mit dem Ion AmpliSeq™Cancer Hotspot Panel v2 erhalten, das die Möglichkeit bietet, eine Probe oder multiplexcodierte Proben mit einem der Ionenchips zu sequenzieren.

Verbesserte Variantenerkennung mit Torrent Suite-Software v3.0
Die intuitive Torrent Suite-Software und das Variant Caller Plugin ermöglichen es Ihnen, innerhalb von nur 10 Stunden von extrahierter DNA zu Variantenaufrufen zu gelangen. Mit verbesserten Algorithmen ist ein Indel-Nachweis mit höherer Empfindlichkeit verbunden, und es kann auch Einzelnukleotid-Polymorphismus (SNP) mit niedrigerer Allel-Häufigkeit empfindlicher nachgewiesen werden. Dann kann die Ion Reporter™ Software für die Annotation von Varianten in DNA-Routineassays für das Voranbringen der klinischen Forschung verwendet werden.