MAGnify™クロマチン免疫沈降システムは、磁気ビーズキャプチャ技術を使用したクロマチン／タンパク質複合体の濃縮およびDNA回収のための合理化され最適化されたアッセイを提供します。分離されたDNAは、PCRまたはqPCRベースのアッセイ、あるいは大規模な並列DNAシーケンシングなどの方法でダウンストリーム分析に使用できます。

ChIP
クロマチン免疫沈降（ChIP）は、特定のタンパク質とゲノムの特定領域との関連性を研究するための強力な技術です。これらの配列特異的DNA結合タンパク質は、DNA複製、組換え、修復、分離、染色体安定性、細胞周期の進行、エピジェネティックサイレンシングなどの細胞プロセスにおいて役割を果たしていると考えられています。標準的なChIPアッセイでは、細胞はホルムアルデヒド処理によって固定され、クロマチンは高特異的な抗体を介してせん断および免疫沈降されます。次に、研究者はDNAを分析して、クロマチン関連タンパク質が in vivoでクロマチンに結合するゲノム領域を特定します。このキットにより、研究者は従来のChIPワークフローよりも少量のサンプルから始めることができ、貴重なサンプルを保存できるため、従来のChIPアッセイでは2–3日かかっていたのに対し、このプロトコルでは1日で完了することができます。このキットは、当社のChIP検証済み抗体一式とともに使用でき、下流エピジェネティクス研究用のMethylCode™およびNCode™製品を補完します。

MAGnify™システムの使用
MAGnify™システムを使用すると、細胞または組織をホルムアルデヒドで処理し、クロマチン複合体内の分子間にタンパク質-タンパク質、およびタンパク質-DNAの架橋を生成できます。次に細胞を溶解し、クロマチンを核から放出して超音波処理によりせん断し、定量リアルタイムPCR（qPCR）による分析では平均DNA断片サイズを200–500 bp に、大規模な並列DNAシーケンシングによる分析では100–300 bpに抑えます。次に、Dynabeads™ タンパク質A/Gに結合した特異的なチップ修飾抗体を使用して、目的の架橋タンパク質を免疫沈降および分離します。ホルムアルデヒドの架橋は熱処理によって逆になり、そのタンパク質に関連するDNAが精製されます。DNAは、エンドポイントPCRや定量PCR（qPCR）、プロモータータイリングアレイを用いたゲノムワイド解析、次世代シーケンシングなどのダウンストリーム解析に使用できるようになりました。PCR/qPCR解析では、プライマーは目的のDNA配列をカバーするように設計されており、データは目的の特定のタンパク質がin vivoでそのDNA領域に関連しているかどうかを示します。