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ラベルトランスファー実験の一般的なプロトコル:
• 数マイクロリットルの溶解したSulfo-SBED試薬をPBS中の精製済み誘引タンパク質0.5~1 mLに添加。
•混合物を暗所で氷上または室温で30~120分間インキュベーション。
•(薄明かりの下で)脱塩または透析して、標識済み誘引タンパク質から余分な未反応のSulfo-SBEDを除去。
•標識誘引タンパク質を、細胞ライセート、またはその他の推定標的相互作用タンパク質(「被誘引」)を含む溶液に添加。
•相互作用複合体が形成されたら、溶液に紫外線(365 nm)を数分間照射。
•以下のいずれかの方法で生成物を分析:
•ウェスタンブロッティング:DTT中のクロスリンクを切断し、SDS-PAGEでタンパク質を分離した後、ストレプトアビジン-HRPを用いたウェスタンブロッティングによりビオチン化バンドを検出。
•精製と質量分析、またはシーケンシング:トリプシン消化の後にビオチン化タンパク質またはペプチド断片をアフィニティー精製し、MSまたはシーケンシングにより、関連するタンパク質を特性評価。
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