BODIPY FLアデノシン5'-三リン酸（A-12410）およびBODIPY FLグアノシン5'-三リン酸は、リンカーを介してリボース環の2'位または3'位に結合されたBODIPY FLフルオロフォアで構成されます。これらのヌクレオチド類似体の分光特性から、フルオロフォアとプリン塩基の相互作用が明らかになります。BODIPY FL GTPの蛍光量子収率は、BODIPY FL ATPの10分の1にすぎません。ただしこの収率は、BODIPY FL GTPをGTP結合タンパク質に結合することで向上させることができます。