GeneRacer™ Kit with SuperScript™ III RT and TOPO TA Cloning™ Kit for Sequencing
GeneRacer™ Kit with SuperScript™ III RT and TOPO TA Cloning™ Kit for Sequencing
Invitrogen™

GeneRacer™ Kit with SuperScript™ III RT and TOPO TA Cloning™ Kit for Sequencing

GeneRacer™キットは、発現シーケンスタグ(EST)、cDNAサブトラクション、差次的発現、またはライブラリスクリーニングから得られる既知の cDNA配列を使用して、完全長の5'末端および3'末端のcDNAを取得する方法を提供します。このキットでは詳細を見る
製品番号(カタログ番号) L150201
価格(JPY)/ 1 kit*
価格155,200
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GeneRacer™キットは、発現シーケンスタグ(EST)、cDNAサブトラクション、差次的発現、またはライブラリスクリーニングから得られる既知の cDNA配列を使用して、完全長の5'末端および3'末端のcDNAを取得する方法を提供します。このキットでは、増幅過程で切断されたメッセージを排除することで、完全長の転写物のみを増幅することができます。RACE PCR産物は、シーケンス用Zero Blunt™ TOPO™ PCRクローニングキット(平滑端末PCR産物)またはシーケンシング用TOPO TAクローニング™キット(3'Aオーバーハングを持つPCR産物)を使用して、迅速かつ簡単にクローニングできます。提供されているプロトコルを使用して、1 µgのtotal RNAから、稀少な転写物(30コピー/細胞)や長い転写物(9 kb)のcDNA末端を増幅し、配列を決定することができます。GeneRacer™キットを使用すると、以下のことが可能になります。

•長さ10 kb以上の転写物からcDNAを生成します
•細胞あたり30コピー未満の希少な転写物の完全長の5´末端配列を得ることができます
•完全長の5´末端配列と3´末端配列をクローニングして、完全なcDNA配列を構築します。SuperScript™ III RT
GeneRacer™キット™は、SuperScript III逆転写酵素(RT)と組み合わせて使用でき、長く複雑なmRNAからの完全長の5´末端の増幅効率を改善します。SuperScript™ III RTのRNase H部分は、cDNA合成時にmRNAの切断を防ぐために変異しています。これによりcDNAの長さと収量が向上します。SuperScript™ III RTは、野生型RTよりも熱安定性が高くなっています。これにより、高温での逆転写、複雑なテンプレートの二次構造の緩和、cDNA合成の完了が可能になります。GeneRacer™キットの仕組み
GeneRacer™キットでは、完全長のcDNA末端を含む転写物のみが増幅されます(図参照)。先進的なプロトコルは、5´キャップされたmRNAのみを特異的に標的とすることで、RNAレベルからスタートします。その後のステップでは、キャップが取り除かれ、GeneRacer™ RNAオリゴに置き換えられます。逆転写時に、GeneRacer™ RNAオリゴの配列がcDNAに組み込まれます。完全に逆転写されたcDNAにのみ、この既知の配列が含まれます。GeneRacer™ RNAオリゴ配列に特異的なGeneRacer™ 5´プライマーと遺伝子特異的なプライマーを用いて5´ RACE PCRを行います。その結果、完全長の5´ cDNA配列を含む増幅DNAが得られます。感度と長さ
GeneRacer™キットが完全長の5´ cDNA末端を捕捉できることを実証するために、既知の転写開始部位を持つ遺伝子の5´末端配列を増幅しました。トータルRNAから始めて、GeneRacer™プロトコルに従って、長い転写物(10 kb)と、0.01%または細胞あたり30コピーしか存在しない希少なメッセージの両方が増幅されました(図参照)。
研究用途にのみご使用ください。診断目的には使用できません。
仕様
菌株または酵母株TOP10
クローニング法TOPO TA
フォーマットキット
使用対象(アプリケーション)逆転写
内容GeneRacerモジュール:2 x 1.5 mL滅菌水、24 μL RnaseOut、各6 μLの子ウシ腸ホスファターゼ(CIP)、CIPバッファー、タバコ酸ピロホスファターゼ(TAP)、10X TAPバッファー、T4 RNAリガーゼ、10X T4 RNAリガーゼバッファー、および10 mm ATP、6 x 250 ng GeneRacer RNAオリゴ、2 x 1 mLフェノール/クロロホルム、36 μLイガイグリコーゲン、200 μL 酢酸ナトリウム(3M)、各225 μL GeneRacer 5'プライマー、 5'ネストプライマー、3'プライマー、および3'ネストプライマー、20μL コントロールHeLaトータルRNA(500 ng/μL)、各15 μLのコントロールプライマーAおよびコントロールプライマー B.1、SuperScript III RT モジュール:μ6 L SuperScript III逆転写酵素(200 U/μL)、24 μL 5Xファーストストランドバッファー、15 μL DTT(0.1 M)、6 μL RNaseH(2 U/μL)、6 μL ランダムプライマー(100 ng/μL)、6 μL GeneRacerオリゴDTプライマー( 900 ng/μL)、6 μL dNTPミックス(各10 mM)、10 S.N.A.P.カラム、シーケンシング用TOPO TAクローニングキット(-20℃)、十分な試薬、ワンショットTOP10ケミカルコンピテント大腸菌
製品ラインGeneRacer™、SuperScript™、TAクローニング™、TOPO™
製品タイプCloning Kit
数量1キット
ベクターpCR4-TOPO TA
Unit Size1 kit*
組成および保存条件
各モジュールは、以下の指示通りに保存してください:

GeneRacer™モジュール(-20℃):

•2 × 1.5 ml滅菌水

• 24 µl RnaseOut™

•各6 µlの子ウシ腸ホスファターゼ(CIP)、CIPバッファー、タバコ酸ピロホスファターゼ(TAP)、10XTAPバッファー、T4 RNAリガーゼ、10X T4 RNAリガーゼバッファー、10X T4 RNAリガーゼバッファー、および10 mm ATP

• 6 × 250 ng GeneRacer™ RNAオリゴ

• 2 × 1 ml フェノール/クロロホルム

• 36 µlイガイグリコーゲン

• 200 µl 酢酸ナトリウム(3 M)

• 各225 µlのGeneRacer™ 5′プライマー、5′ネストプライマー、3′プライマー、および3′ネストプライマー

• 20 µLコントロールHeLaトータルRNA(500 ng/µl)

•各15 µlのコントロールプライマーAおよびコントロールプライマー B.1

SuperScript™ III RTモジュール(-20℃)

• 6 µl SuperScript™ III逆転写酵素(200 U/µl)

• 24 µl 5Xファーストストランドバッファー

• 15 µl DTT(0.1 M)

• 6 µl RNaseH(2 U/µl)

• 6 µl ランダムプライマー(100 ng/µl)

• 6 µl GeneRacer™オリゴDTプライマー(900 ng/µl)

• 6 µl dNTPミックス(各10 mm)

10 S.N.A.P.™カラム(室温)

、シーケンシング用TOPO TA Cloning™キット(-20℃)

• 十分な試薬およびOne Shot™ TOP10ケミカルコンピテント大腸菌(-80℃で保存)により、10のGeneRacer™ PCR産物をクローニング;GeneRacerモジュール(-20℃)、SuperScript III RTモジュール(-20℃)、コンピテント大腸菌(-80℃で保存)、S.N.A.P.カラム(室温)、シーケンシング用TOPO TAクローニングキット(-20℃)