Illuminaシステム用Invitrogen Collibri標準mRNAライブラリ調製キットは、Illumina次世代シーケンシング（NGS）システムでのストランド固有のRNAシーケンシングに使用する堅牢なcDNAライブラリを構築するように設計されています。SuperScript IV逆転写酵素、Dynabeads磁気粒子、Platinum SuperFi DNAポリメラーゼの優れた特徴が結合されたこのキットでは、高品質のシーケンシング対応ライブラリを得ることができます。

Collibri Stranded RNAライブラリ調製キットの特長：
•短時間で自動化しやすいワークフロー— 6.5時間以内にトータルRNAをシーケンシング対応ライブラリに転換できます
• 試薬に含まれる不活性色素—品質に悪影響を与えることなく、ライブラリ調製の進捗を確認可能にします
• 卓越したrRNA除去
• 均一の転写カバレッジと高感度の転写物検出
• 高感度の差次的遺伝子発現の検出
• >98%のストランド特異性
• ノンコーディングRNAの効率的検出
• 3‘末端配列情報の保持

このCollibri Stranded RNA Library Prep Kitは、ヒト、マウス、またはラットのトータルRNAの最小サンプル入力量100 ng～1 μgで、利便性の高いライブラリ調製を迅速に行えるように設計されています。シングルチューブアダプターのライゲーションおよび逆転写反応、ならびに磁気ビーズベースのrRNA除去およびライブラリ精製ステップにより、約6.5時間でワークフロー全体を完了できます。このキットは、FFPEサンプルを含むさまざまな品質のRNAサンプルに適しています。

プロセスの完全性の視覚的な手がかり
最大限の利便性をもたらすために、ライブラリ調製ワークフロー全体で、プロセスの完全性を視覚的に確認できるようになっています。重要な試薬に含まれる色素による視覚的フィードバックを手がかりに、ライブラリ生成の進捗をモニタリングできます。最大限の確率でライブラリ調製を成功させられるよう、各ステップで重要な成分が追加されると、反応混合物の色が変化するようになっています。不活性色素は酵素反応に干渉せず、シーケンシング結果を損なうこともありません。

仕組み
ヒト／マウス／ラットrRNA除去キット付きCollibri標準RNAライブラリ調製キットには、リボソームRNA（rRNA）除去試薬が含まれており、ヒト／マウス／ラットのrRNAを効果的に除去してトランスクリプトームを包括的に確認できます。Platinum SuperFi DNAポリメラーゼを使用したPCR増幅により、Illumina対応の全長アダプターが導入されて、シングルリードまたはペアエンドシーケンシングに適合するシングルインデックスライブラリまたは独自のデュアルインデックスライブラリが構築されます。このキットには、24または96のプライマー（汎用i5プライマーと事前に混合されたシングルインデックスバーコードPCRプライマー（i7）、または独自のデュアルインデックスPCRプライマーのいずれか）が含まれており、最大96のライブラリの多重化に対応できます。最適化されたクリーンアップステップにより、ライブラリの高収率を維持しながら、残存プライマーおよびアダプター／プライマーダイマーを効率的に除去できます。

シーケンシングに進む前にqPCRベースでライブラリを定量化するには、関連製品のCollibriライブラリ定量化キットの使用が推奨されます。

アプリケーション
Collibri Stranded RNAライブラリ調製キットは次の用途におすすめします。
•遺伝子発現研究
• 選択的スプライシング解析
• ノンコーディングRNA検出および発見
• 代替ポリアデニル化部位の識別
• 遺伝子融合検出
• 転写産物アイソフォームの検出